自然科学是理学、工学、农学、医学4个学科的统称，也就是每年高考中的理科。自然科学(理科)的研究对象是物质本身。本书的自然科学排名，体现了各大学自然科学4个学科的综合实力。因此，仅在自然科学某一学科领先的大学，并不意味着一定能在整个自然科学排名中领先。为了既反映各大学自然科学的综合实力，又反映各大学理学、工学、农学、医学各自的实力，本节将各大学自然科学排名和理学、工学、农学、医学各自的排名一一列出，供报考理科的考生参考。
自然科学(理科)共有52个学科类、146个本科目录内专业。在本书中，设立自然科学本科专业的大学共664所。
自然科学是人类认识和改造物质世界的科学，一个国家的自然科学水平决定了这个国家认识和改造物质世界的能力。
武书连2012中国大学自然科学B级以上学校名单(其中B级排名不分先后)
| 排名 | 等级 | 校名 |
| 1 | A++ | 浙江大学 |
| 2 | A++ | 清华大学 |
| 3 | A++ | 上海交通大学 |
| 4 | A++ | 北京大学 |
| 5 | A++ | 复旦大学 |
| 6 | A++ | 哈尔滨工业大学 |
| 7 | A++ | 南京大学 |
| 8 | A++ | 中山大学 |
| 9 | A++ | 四川大学 |
| 10 | A++ | 华中科技大学 |
| 11 | A++ | 中国科学技术大学 |
| 12 | A++ | 山东大学 |
| 13 | A++ | 吉林大学 |
| 14 | A++ | 武汉大学 |
| 15 | A+ | 中南大学 |
| 16 | A+ | 天津大学 |
| 17 | A+ | 大连理工大学 |
| 18 | A+ | 西安交通大学 |
| 19 | A+ | 东南大学 |
| 20 | A+ | 南开大学 |
| 21 | A+ | 华南理工大学 |
| 22 | A+ | 北京航空航天大学 |
| 23 | A+ | 同济大学 |
| 24 | A+ | 西北工业大学 |
| 25 | A+ | 兰州大学 |
| 26 | A+ | 北京理工大学 |
| 27 | A+ | 中国农业大学 |
| 28 | A+ | 华东理工大学 |
| 29 | A+ | 厦门大学 |
| 30 | A+ | 重庆大学 |
| 31 | A+ | 南京航空航天大学 |
| 32 | A+ | 湖南大学 |
| 33 | A+ | 南京农业大学 |
| 34 | A+ | 电子科技大学 |
| 35 | A | 苏州大学 |
| 36 | A | 东华大学 |
| 37 | A | 南京理工大学 |
| 38 | A | 北京师范大学 |
| 39 | A | 首都医科大学 |
| 40 | A | 北京化工大学 |
| 41 | A | 上海大学 |
| 42 | A | 北京科技大学 |
| 43 | A | 江南大学 |
| 44 | A | 西安电子科技大学 |
| 45 | A | 华东师范大学 |
| 46 | A | 中国海洋大学 |
| 47 | A | 西北农林科技大学 |
| 48 | A | 郑州大学 |
| 49 | A | 东北大学 |
| 50 | A | 武汉理工大学 |
| 51 | A | 东北师范大学 |
| 52 | A | 中国药科大学 |
| 53 | A | 哈尔滨工程大学 |
| 54 | A | 北京工业大学 |
| 55 | A | 华中农业大学 |
| 56 | A | 南京医科大学 |
| 57 | A | 西南大学 |
| 58 | A | 浙江工业大学 |
| 59 | A | 北京交通大学 |
| 60 | A | 扬州大学 |
| 61 | A | 南京工业大学 |
| 62 | A | 南昌大学 |
| 63 | A | 福州大学 |
| 64 | A | 中国石油大学(北京) |
| 65 | A | 西南交通大学 |
| 66 | A | 燕山大学 |
| 67 | A | 江苏大学 |
| 68 | B+ | 华中师范大学 |
| 69 | B+ | 中国地质大学(北京) |
| 70 | B+ | 暨南大学 |
| 71 | B+ | 河海大学 |
| 72 | B+ | 沈阳药科大学 |
| 73 | B+ | 中国地质大学(武汉) |
| 74 | B+ | 中国医科大学 |
| 75 | B+ | 西北大学 |
| 76 | B+ | 陕西师范大学 |
| 77 | B+ | 南方医科大学 |
| 78 | B+ | 中国石油大学(华东) |
| 79 | B+ | 重庆医科大学 |
| 80 | B+ | 哈尔滨医科大学 |
| 81 | B+ | 华南师范大学 |
| 82 | B+ | 华北电力大学 |
| 83 | B+ | 合肥工业大学 |
| 84 | B+ | 山东农业大学 |
| 85 | B+ | 华南农业大学 |
| 86 | B+ | 中国矿业大学 |
| 87 | B+ | 北京邮电大学 |
| 88 | B+ | 南京师范大学 |
| 89 | B+ | 青岛科技大学 |
| 90 | B+ | 湖南师范大学 |
| 91 | B+ | 温州医学院 |
| 92 | B+ | 湘潭大学 |
| 93 | B+ | 四川农业大学 |
| 94 | B+ | 汕头大学 |
| 95 | B+ | 山西大学 |
| 96 | B+ | 广西大学 |
| 97 | B+ | 北京林业大学 |
| 98 | B+ | 长安大学 |
| 99 | B+ | 东北林业大学 |
| 100 | B+ | 河北大学 |
| 101 | B+ | 天津医科大学 |
| 102 | B+ | 宁波大学 |
| 103 | B+ | 安徽师范大学 |
| 104 | B+ | 云南大学 |
| 105 | B+ | 昆明理工大学 |
| 106 | B+ | 太原理工大学 |
| 107 | B+ | 北京中医药大学 |
| 108 | B+ | 河南大学 |
| 109 | B+ | 青岛大学 |
| 110 | B+ | 河北医科大学 |
| 111 | B+ | 安徽医科大学 |
| 112 | B+ | 河南师范大学 |
| 113 | B+ | 河北农业大学 |
| 114 | B+ | 成都理工大学 |
| 115 | B+ | 南京信息工程大学 |
| 116 | B+ | 浙江理工大学 |
| 117 | B+ | 浙江师范大学 |
| 118 | B+ | 上海中医药大学 |
| 119 | B+ | 上海师范大学 |
| 120 | B+ | 南京林业大学 |
| 121 | B+ | 西北师范大学 |
| 122 | B+ | 新疆大学 |
| 123 | B+ | 山东师范大学 |
| 124 | B+ | 上海理工大学 |
| 125 | B+ | 西安理工大学 |
| 126 | B+ | 贵州大学 |
| 127 | B+ | 河南农业大学 |
| 128 | B+ | 沈阳农业大学 |
| 129 | B+ | 东北农业大学 |
| 130 | B+ | 安徽大学 |
| 131 | B+ | 南通大学 |
| 132 | B+ | 福建医科大学 |
| 133 | B+ | 广州中医药大学 |
| B | 中国矿业大学(北京) | |
| B | 中北大学 | |
| B | 首都师范大学 | |
| B | 天津工业大学 | |
| B | 湖南农业大学 | |
| B | 华侨大学 | |
| B | 河北工业大学 | |
| B | 南京中医药大学 | |
| B | 福建师范大学 | |
| B | 济南大学 | |
| B | 湖北大学 | |
| B | 聊城大学 | |
| B | 辽宁师范大学 | |
| B | 福建农林大学 | |
| B | 温州大学 | |
| B | 兰州理工大学 | |
| B | 甘肃农业大学 | |
| B | 河北师范大学 | |
| B | 陕西科技大学 | |
| B | 西安建筑科技大学 | |
| B | 深圳大学 | |
| B | 广西师范大学 | |
| B | 长沙理工大学 | |
| B | 山东理工大学 | |
| B | 广州医学院 | |
| B | 杭州电子科技大学 | |
| B | 广东工业大学 | |
| B | 徐州师范大学 | |
| B | 广西医科大学 | |
| B | 河南科技大学 | |
| B | 浙江农林大学 | |
| B | 中国人民大学 | |
| B | 天津科技大学 | |
| B | 曲阜师范大学 | |
| B | 南京邮电大学 | |
| B | 山西师范大学 | |
| B | 湖南科技大学 | |
| B | 大连医科大学 | |
| B | 山东科技大学 | |
| B | 大连海事大学 | |
| B | 上海海洋大学 | |
| B | 广州大学 | |
| B | 山西农业大学 | |
| B | 兰州交通大学 | |
| B | 内蒙古农业大学 | |
| B | 长春理工大学 | |
| B | 南华大学 | |
| B | 黑龙江大学 | |
| B | 武汉科技大学 | |
| B | 烟台大学 | |
| B | 天津师范大学 | |
| B | 中国计量学院 | |
| B | 延边大学 | |
| B | 西华师范大学 | |
| B | 山西医科大学 | |
| B | 安徽农业大学 | |
| B | 西南科技大学 | |
| B | 石河子大学 | |
| B | 桂林理工大学 | |
| B | 四川师范大学 | |
| B | 常州大学 | |
| B | 昆明医学院 | |
| B | 杭州师范大学 | |
| B | 河南理工大学 | |
| B | 中南民族大学 | |
| B | 中南林业科技大学 | |
| B | 渤海大学 |
B级以下大学的等级见武书连主编、中国统计出版社出版的《挑大学 选专业—2012高考志愿填报指南》第4章。
2012中国大学学科门等级评价采用百分比法，用A、B、C、D、E共5等11级表示各大学的实力。各等级定义如下：
A等：前10%为A等；其中实力最强的前2%是A++级，介于2%～5%(含，以下同)之间的是A+级，5%~10%为A级。
B等：介于10%～30%之间为B等，占20%；其中 10%~20%为B+级，20%~30%为B级。
C等：介于30%～50%之间为C等，占20%；其中 30%~40%为C+级，40%~50%为C级。
D等：介于50%～70%之间为D等，占20%；其中50%~60%为D+级，60%~70%为D级。
E等：最后的30%为E等；其中70%～85%为E+级，85%~100%为E级。
附表：中国本科大学各学科毕业本科生、硕士生、博士生数量及百分比。
| 2011年毕业本科生 | 2010年毕业硕士生 | 2011年毕业博士生 | ||||
| 数量 | 百分比 | 数量 | 百分比 | 数量 | 百分比 | |
| 总计 | 2560758 | 100.00 | 313981 | 100.00 | 50249 | 100.00 |
| 理科合计 | 1310110 | 51.16 | 189240 | 60.27 | 35840 | 71.32 |
| 文科合计 | 1250648 | 48.84 | 124742 | 39.73 | 14409 | 28.68 |
| 理学 | 275214 | 10.75 | 32624 | 10.39 | 6918 | 13.77 |
| 工学 | 801379 | 31.29 | 110247 | 35.11 | 21412 | 42.61 |
| 农学 | 49317 | 1.93 | 11832 | 3.77 | 1944 | 3.87 |
| 医学 | 184200 | 7.19 | 34537 | 11.00 | 5567 | 11.08 |
| 哲学 | 1909 | 0.07 | 3809 | 1.21 | 701 | 1.40 |
| 经济学 | 154361 | 6.03 | 14923 | 4.75 | 2597 | 5.17 |
| 法学 | 113342 | 4.43 | 23224 | 7.40 | 2305 | 4.59 |
| 教育学 | 89653 | 3.50 | 12421 | 3.96 | 873 | 1.74 |
| 文学 | 288014 | 11.25 | 28205 | 8.98 | 2150 | 4.28 |
| 历史学 | 13660 | 0.53 | 4194 | 1.34 | 893 | 1.78 |
| 管理学 | 408552 | 15.95 | 37965 | 12.09 | 4891 | 9.73 |
| 艺术学 | 181158 | 7.07 | ||||
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