根据国家重点学科及实验室、省部级重点学科及实验室、博士点、院士、长江学者、国家杰青、国家人才计划、论文数量、博导数量、附属医院实力综合评价）（括号里为主要闻名附属医院）
1.清华大学北京协和医学院（北京协和医院、阜外心血管病医院、肿瘤医院）
2.北京大学医学部（人民医院、第一医院、第二医院、积水潭医院）
3.复旦大学上海医学院（中山医院、妇产科医院、华山医院）
4.上海交通大学医学院（瑞金医院、仁济医院、新华医院、上海六院、上海九院）
5.华中科技大学同济医学院（同济医院、武汉协和医院、梨园医院）
6.中山大学中山医学院（中山一院、中山二院、中山三院肿瘤医院）
7.四川大学华西医学中心（华西医院、华西妇产儿童医院、华西口腔医院）
8.第二军医大学（长征医院、长海医院、东方肝胆医院）
9.第四军医大学（唐都医院、西京医院、口腔医院）
10.第三军医大学（西南医院、新桥医院、大坪医院）
11.中南大学湘雅医学院（湘雅一院、湘雅二院）
12.北京中医药大学（东直门医院、护国寺中医医院）
13.浙江大学医学院（浙医一院、浙医二院、邵逸夫医院）
14.中国医科大学（盛京医院、中国医大一院、中国医大四院）
15.南方医科大学（南方医院、珠江医院）
16.首都医科大学（同仁医院、宣武医院、安贞医院、佑安医院）
17.哈尔滨医科大学（附属一院、二院、肿瘤医院）
18.广州中医药大学（第一附属医院、第二附属医院）
19.吉林大学白求恩医学部（白求恩第一医院、白求恩第二医院、白求恩第三医院）
20.山东大学医学院（齐鲁医院、山大二院、省立医院）
21.西安交通大学医学院（第一医院、第二医院、中日联谊医院）
22.重庆医科大学（第一医院、第二医院、儿童医院）
23.天津医科大学（总医院、医大二附属医院、肿瘤医院）
24.武汉大学医学院（湖北省人民医院、中南医院）
25.上海中医药大学（曙光医院、龙华医院、中医医院）
26.南京大学医学院（鼓楼医院、南京军区总医院）
27.南京医科大学（第一附属、第二附属医院）
28.汕头大学医学院（第一附属、第二附属，附属肿瘤医院）
29.山东中医药大学（第一附属、第二附属医院）
30青岛大学医学院（青岛大学医疗集团）
31.河北医科大学（附属第一医院、第二医院）
32.郑州大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
33.苏州大学医学院（附属第一医院）
34.安徽医科大学（第一附属医院、附属省立医院）
35.福建医科大学（附属第一医院、附属第二医院、附属协和医院 ）
36.广西医科大学（附属第一医院、肿瘤医院）
37.温州医学院（附属第一医院、第二医院）
38.南京中医药大学（江苏省中医院、第二附属医院）
39.山西医科大学（附属第一医院、第二医院）
40.新疆医科大学（第一附属医院、第二附属医院）
41.兰州大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
42.大连医科大学（附属第一医院、第二医院）
43.暨南大学医学院（广州华侨医院、珠海市人民医院）
44.东南大学医学院（中大医院）
45.南昌大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
46.昆明医学院（第一附属医院、第二附属医院）
47.同济大学医学院（上海十院、同济医院）
48.广州医学院（第一附属医院、第二附属医院）
49.广东医学院（广东医学院附属医院）
50.新乡医学院（新乡医学院第一附属医院）
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